1989年，國有企業章丘市玻璃廠被迫轉產，生產單一產品—肌苷原料藥，更名為濟南市明水制藥廠。
1995年， 歷經五任國企廠長后，濟南市明水制藥廠最終資不抵債，被迫宣布破產。
1997年9月18日，時任黃河鄉副鄉長的黃葆新臨危受命，接受章丘市政府委派接管已破產的濟南市明水制藥廠。
1998年，黃葆新廠長組織恢復生產，企業當年扭虧增盈。
2000年，企業銷售收入過千萬元。
2002年12月，濟南市明水制藥廠完成國企改制，更名濟南明鑫制藥有限公司。
2003年3月，公司肌苷原料和成品藥車間通過國家藥品監督管理局進行的GMP現場認證檢查，獲得GMP證書。
2005年，公司上利巴韋林和三磷酸腺苷二鈉生產車間，打破單一產品經營局面。
2006年3月，利巴韋林和三磷酸腺苷二鈉車間通過GMP認證，獲得GMP證書。
2007年3月，合成車間通過丁咯地爾，特比奈芬，環磷腺苷，泮托拉唑鈉，那格列奈認證，獲得GMP證書。
2007年9月，公司全面停產，籌建新廠。
2008年5月8日，新廠建設奠基。
2009年8月，新廠投入運營，公司更名為濟南明鑫制藥股份有限公司。
2009年9月1日，公司所有原料藥和成品藥試生產。
2009年11月，公司所有原料藥和成品藥通過GMP認證。
